Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo48Q8CAT8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo48Q8CAT8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fbxo48Q8CAT8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms