Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg4aQ8C9S8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg4aQ8C9S8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg4aQ8C9S8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg4aQ8C9S8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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