Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc15Q8C9M2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc15Q8C9M2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms