Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q8C3W1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q8C3W1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q8C3W1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q8C3W1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q8C3W1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q8C3W1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Q8C3W1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q8C3W1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q8C3W1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q8C3W1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q8C3W1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q8C3W1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q8C3W1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q8C3W1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q8C3W1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms