Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp44Q8C2S0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp44Q8C2S0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp44Q8C2S0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp44Q8C2S0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp44Q8C2S0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp44Q8C2S0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp44Q8C2S0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp44Q8C2S0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp44Q8C2S0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
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