Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8C1R3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8C1R3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8C1R3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8C1R3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8C1R3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8C1R3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8C1R3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8C1R3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8C1R3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8C1R3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms