Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa22Q8C1N8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa22Q8C1N8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms