Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx16Q8C080 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx16Q8C080 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx16Q8C080 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx16Q8C080 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms