Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm4aQ8BW72 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm4aQ8BW72 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Kdm4aQ8BW72 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261.2 ms