Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pggt1bQ8BUY9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pggt1bQ8BUY9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms