Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp43Q8BUM9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp43Q8BUM9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp43Q8BUM9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp43Q8BUM9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp43Q8BUM9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp43Q8BUM9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp43Q8BUM9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp43Q8BUM9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp43Q8BUM9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp43Q8BUM9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp43Q8BUM9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp43Q8BUM9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp43Q8BUM9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp43Q8BUM9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms