Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU6

Slc18a2, Synaptic vesicular amine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a2Q8BRU6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc18a2Q8BRU6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc18a2Q8BRU6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc18a2Q8BRU6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms