Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rd3Q8BRE0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rd3Q8BRE0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rd3Q8BRE0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms