Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo38Q8BMI0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo38Q8BMI0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo38Q8BMI0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms