Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Usp54Q8BL06 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp54Q8BL06 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp54Q8BL06 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Usp54Q8BL06 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Usp54Q8BL06 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Usp54Q8BL06 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp54Q8BL06 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Usp54Q8BL06 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Usp54Q8BL06 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp54Q8BL06 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp54Q8BL06 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp54Q8BL06 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp54Q8BL06 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms