Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIV3

Ranbp6, Ran-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp6Q8BIV3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ranbp6Q8BIV3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ranbp6Q8BIV3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ranbp6Q8BIV3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ranbp6Q8BIV3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ranbp6Q8BIV3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ranbp6Q8BIV3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ranbp6Q8BIV3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ranbp6Q8BIV3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ranbp6Q8BIV3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ranbp6Q8BIV3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ranbp6Q8BIV3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ranbp6Q8BIV3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ranbp6Q8BIV3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms