Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdca8Q8BHX3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca8Q8BHX3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdca8Q8BHX3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdca8Q8BHX3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 692.7 ms