Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabra5Q8BHJ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabra5Q8BHJ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms