Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX3

Kctd3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd3Q8BFX3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kctd3Q8BFX3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kctd3Q8BFX3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd3Q8BFX3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd3Q8BFX3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd3Q8BFX3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd3Q8BFX3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd3Q8BFX3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kctd3Q8BFX3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kctd3Q8BFX3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kctd3Q8BFX3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kctd3Q8BFX3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms