Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc17a8Q8BFU8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a8Q8BFU8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a8Q8BFU8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a8Q8BFU8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms