Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfascQ810U3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfascQ810U3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms