Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc181Q80ZU5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc181Q80ZU5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc181Q80ZU5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms