Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkhd1l1Q80ZA4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkhd1l1Q80ZA4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkhd1l1Q80ZA4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkhd1l1Q80ZA4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkhd1l1Q80ZA4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkhd1l1Q80ZA4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkhd1l1Q80ZA4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkhd1l1Q80ZA4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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