Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alkbh8Q80Y20 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Alkbh8Q80Y20 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262 ms