Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ell3Q80VR2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ell3Q80VR2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ell3Q80VR2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ell3Q80VR2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ell3Q80VR2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ell3Q80VR2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ell3Q80VR2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ell3Q80VR2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ell3Q80VR2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ell3Q80VR2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ell3Q80VR2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ell3Q80VR2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ell3Q80VR2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms