Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Avl9Q80U56 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Avl9Q80U56 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Avl9Q80U56 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms