Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19,93■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19,93■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19,92■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19,92■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19,91■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
ScocQ78YZ6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19,89■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,87■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19,87■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19,87■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,86■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19,86■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,84■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19,84■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19,84■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,84■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,83■□□□□ 0,77
ScocQ78YZ6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,82■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,82■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19,82■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,81■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19,8■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19,8■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19,8■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,8■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19,77■□□□□ 0,76
ScocQ78YZ6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
ScocQ78YZ6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
ScocQ78YZ6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
ScocQ78YZ6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19,76■□□□□ 0,75
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