Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim12Q78RX3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms