Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Snd1Q78PY7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snd1Q78PY7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms