Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zc3h4Q6ZPZ3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zc3h4Q6ZPZ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zc3h4Q6ZPZ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms