Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd4Q6ZPR5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smpd4Q6ZPR5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms