Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn5Q6VZZ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Opn5Q6VZZ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn5Q6VZZ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn5Q6VZZ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms