Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt9Q6RHW0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt9Q6RHW0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt9Q6RHW0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt9Q6RHW0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms