Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tcaf3Q6QR59 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf3Q6QR59 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf3Q6QR59 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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