Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp2b4Q6Q477 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp2b4Q6Q477 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atp2b4Q6Q477 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp2b4Q6Q477 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp2b4Q6Q477 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms