Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnip4Q6PHZ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip4Q6PHZ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip4Q6PHZ8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip4Q6PHZ8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms