Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfrlQ6PE55 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfrlQ6PE55 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PdgfrlQ6PE55 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfrlQ6PE55 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms