Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc85bQ6PDY0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85bQ6PDY0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms