Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2lQ6PDS0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm2lQ6PDS0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms