Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcc2Q6PDG5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcc2Q6PDG5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcc2Q6PDG5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms