Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgb4Q6P8W9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb4Q6P8W9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms