Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BC061212Q6P8K3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BC061212Q6P8K3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BC061212Q6P8K3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BC061212Q6P8K3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BC061212Q6P8K3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms