Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Senp6Q6P7W0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Senp6Q6P7W0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Senp6Q6P7W0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Senp6Q6P7W0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Senp6Q6P7W0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Senp6Q6P7W0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Senp6Q6P7W0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Senp6Q6P7W0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Senp6Q6P7W0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Senp6Q6P7W0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Senp6Q6P7W0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Senp6Q6P7W0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Senp6Q6P7W0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms