Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc148Q6P5U8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc148Q6P5U8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc148Q6P5U8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms