Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frg2f1Q6P3A2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg2f1Q6P3A2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg2f1Q6P3A2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms