Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ptpdc1Q6NZK8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ptpdc1Q6NZK8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ptpdc1Q6NZK8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpdc1Q6NZK8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms