Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rprd2Q6NXI6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rprd2Q6NXI6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Rprd2Q6NXI6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rprd2Q6NXI6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms