Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Carmil1Q6EDY6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Carmil1Q6EDY6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Carmil1Q6EDY6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Carmil1Q6EDY6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Carmil1Q6EDY6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Carmil1Q6EDY6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms