Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf8Q6DID3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf8Q6DID3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf8Q6DID3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf8Q6DID3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms