Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Smarca2Q6DIC0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Smarca2Q6DIC0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Smarca2Q6DIC0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Smarca2Q6DIC0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.94
Smarca2Q6DIC0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Smarca2Q6DIC0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms